Genomisk avlsværdivurdering for kødkvæg anvendt på malkekvæg

Projektansvarlig: Anders Fogh

De forventede resultater fra projektet bliver offentliggjort på denne internetside:
4. kvartal 2024. Projektets resultater stilles gratis til rådighed

Introduktion: Formålet er at booste det avlsmæssige potentiale for slagtekalve i Danmark for egenskaber, der påvirker produktion, sundhed, dødelighed, velfærd og økonomi. Det vil vi gøre gennem udvikling af genomiske avlsværdital for fødsels-, sundheds-, overlevelses- og slagteegenskaber samt udvikling af et indeks for slagteprocent. Vi ved, at genomiske avlsværdital har potentiale til, som minimum, at fordoble den årlige avlsmæssige fremgang i forhold til det, der er muligt med de nuværende avlsredskaber. Fremadrettet skal udvælgelsen af kødkvægs-tyre, der bruges til inseminering af malkekvæg, baseres på genomisk information i stedet for resultater fra afkom. I projektet vil vi derfor udvikle og implementere de mest avancerede metoder til beregning af genomiske avlsværdital for alle de egenskaber, vi allerede i dag beregner almindelige avlsværdital for. Der skal udvikles genomiske avlsværdital for fire egenskabsgrupper. For hver egenskab i disse grupper indebærer det test og validering af de opnåede resultater. Udgangspunktet er den genomiske referencegruppe, som er opbygget i projektet FutureBeefCross, men der skal i dette projekt tages højde for, at kalve, som er døde ved fødsel og i opdrætsperioden, ikke er repræsenteret i referencen. De døde kalve genomisk testes i indeværende projekt. Dette er nødvendigt for sikre genomiske avlsværdital for overlevelse ved og efter fødsel. Der vil også blive udviklet genomiske avlsværdital for slagteprocent, som er en ny og økonomisk vigtig egenskab. Da egenskaben er ny, skal der udvikles en editering som udgangspunkt for udviklingen af genomiske avlsværdital. Projekts resultater formidles til kvægbrugere, avlsrådgivere og andre interessenter for at sikre, at resultaterne anvendes efter projektets afslutning. Med de redskaber der udvikles, forventer vi, at den avlsmæssige fremgang kan øges fra 8 kr. pr. år til 16 kr. pr år. Efter 5 års effektivt avlsarbejde vil det betyde en årlig merværdi på 24 mio. kr. for hele kvægsektoren, hvis der produceres 200.000 krydsningsslagtekalve pr. år

Projektresultater:

AP 2

Correlation_between_phenotypes_and_SSBV_for_BxD_calves
Correlation between breeding values and phenotypes 

Correlations_for_feed_efficiency_for_BxD_calves
Correlation between singlestep breeding values and phenotypes for BxD calves 

Correlations_for_SSBV_for_BBLbulls_with_50_offspring
Correlation between singlestep breeding values for BBLbulls with minimum 50 offspring for yss1

Data og model anvendt for BxD egenskaber
Beskrivelse af data, model og parametre for egenskaberne

Data og model for BxD egenskaber v2
Opdateret beskrivelse af data, model og parametre for egenskaberne 

Genetic_trend_for_BBLbulls_with_minimum_of_50_offspring_with_phenotype
Genetic trend curves for the evaluation 

Genetisk trend for BBLtyre med 50 afkom
Trendkurver for egenskaberne

Korrelationer mellem indekser for BBLtyre
Korrelationer mellem indekser for BBLtyre med minimum 50 afkom for YYS1

Number_of_phenotypes_and_genotypes_included_in_the_evaluation
Information for the evaluation 

Singlestep for BxD blending meeting
Powerpoint præsentation

Validation_of_HOLbulls_with_monthly_breeding_values
Analysis of the prediktability for CARCtraits

Validation_of_HOLbulls_with_monthly_breeding_values_v2
Updated analysis of predictability for GEBV for CARCtraits by SNPsolutions

Validation_of_HOLbulls_with_monthly_breeding_values_v3
Updated analysis of predictability for GEBV for CARCtraits by SNPsolutions and polygenic effects

Validation_of_indexes_for_14_BBLbulls_ENG
Compare full and reduced run for EBV and singlestep for BBLbulls

Validation_of_indexes_for BxD_calves_birthdatecut_ENG
Compare full and reduced run for EBV and singlestep for BxD calves 

Validering af nogle indekser ud fra BBLtyre
Sammenligning af full og reduced kørsel for EBV og for singlestep

Validering af nogle indekser ud fra krydsningskalve
Sammenligning af full og reduced kørsel for EBV og for singlestep

AP3

Filformat til udsendelse af genomiske indekser for BxD
Filformat til udsendelse af genomiske indekser for BxD fx ved udsendelse af indekser på kandidat tyre fra et kvægavlsfirma