Avl med fokus på klima, dyrevelfærd og økonomi

Projektansvarlig: Anders Fogh

De forventede resultater fra projektet bliver offentliggjort på denne internetside:
4. kvartal 2022. Projektets resultater stilles gratis til rådighed

Introduktion: Formålet er at forbedre fremtidens mælkeproduktion, så den er mere lønsom for kvægbrugeren, afsætter et mindre klimaaftryk samtidig med, at køerne har et længere og bedre liv. Det stiller krav til fremtidens malkeko, og udviklingen af redskaberne på avlsområdet er grundlaget for, at den kan levere på alle parametre.

Vi vil udvikle de bedste avlsredskaber, så vi har endnu bedre mulighed for at udvælge de køer og insemineringstyre, der genetisk har det højeste niveau for alle de egenskaber, der betyder mest for produktionsøkonomi, klimapåvirkning og dyrevelfærd. Vi vil udvikle og implementere de nyeste beregningsteknikker, som giver basis for at opnå den største avlsmæssige fremgang. Fremgangen skal være bæredygtig, afbalanceret og give flest kroner på bundlinjen. Det kræver det bedste avlsmål, som kontinuert har fokus på forhold mellem indtægter og omkostninger, fanger ændringer i samfundet og tager højde for, hvilke forhold fremtidens ko skal producere under. Der informeres løbende om de udviklede værktøjer for at sikre implementeringen hos både kvægbrugere og deres rådgivere.

Projektet har potentiale til at øge indtjeningen med 30 mio. kr. årligt, samtidig med at frekvensen af yverlidelser sænkes med 0,1 % årligt og holdbarhed øges med 2 dage årligt. Metanudledningen kan sænkes med en udledning svarende til omkring 158.000 tons årligt.

Effekterne akkumuleres over år og har dermed meget stort potentiale. Dette projekt er det danske bidrag til NAVs udviklingsarbejde.

Projektresultater:

AP 1

Calving snell score, summery statistics 
Sammenligning af de nuværdende avlsværdier og de nye snell score avlsværdier 

Comparison of current pedigree and proposed for production test day model
Effect of using a simpler pedigree in the singlestep production evaluation 

Comparison of singlestep and current evaluation for type traits
Comparison of singlestep, focusing on females and Nordic AI bulls 

Comparison of singlestep May22 and Aug22
Comparing breeding values for type traits for two following singelstep evalutation. Focus on Nordic AI bulls and genotyped females. 

Comparison of singlestep May2022 and official May2022
Undersøgelse af nuværende og singelstep evaluering for typeegenskaber

Comparison of snell score data and current data
Data brugt for RDC 

Correlation between Singlestep and Twostep for AI bulls (May and June 2022)
Correlations between breeding values for singlestep evaluation and current twostep evaluation 

Correlations and variance for current and snell score evaluation v1
Oversigt over de parametre som er anvendt i opsætning af nuværende model og i snell score model for Holstein, RDC og Jersey 

Correlations and variance for current and snell score evaluation v2
Opdatering af de parametre som er anvendt i opsætning af nuværende model og i snell score model for RDC

Effect of old genotypes Jersey
Undersøgelse af effekt af singlestep hvor genotyper på dyr født før 2005 er fjernet 

Final parameters used in the snell score model 
Oversigt over de nye parametre, som anvendes

Final report for calving traits 
Afsluttende rapport over ændringerne i kælvningsegenskaberne

Fænotypiske korrelationer for kælvningsegenskaber v1
Korrelation for RDCtyre mellem gennemsnitlig nuværende kælvningsværdi og gennemsnitlige værdi på snell score skala. 

Fænotypiske korrelationer for kælvningsegenskaber v2
Korrelation for RDCtyre mellem gennemsnitlig nuværende kælvningsværdi og gennemsnitlige værdi på snell score skala. 

GEBV korrelationer for kælvningsegenskaber v1
Korrelationer for RDCtyre mellem genomiske avlsværdier på nuværende data og nuværende model og på snell score data og snell score model 

GEBV korrelationer for kælvningsegenskaber v2
Korrelationer for RDCtyre mellem genomiske avlsværdier på nuværende data og nuværende model og på snell score data og snel score model

GEBV korrelationer for kælvningsegenskaber v3
Korrelationer for RDCtyre mellem genomiske avlsværdier på nuværende data og nuværende model og på snell score data og snell score model 

GEBV korrelationer for kælvningsegenskaber v4
Korrelationer for RDCtyre mellem genomiske avlsværdier på nuværende data og nuværende model og på snell score data og snell score model 

GEBV korrelationer for kælvningsegenskaber v5
Korrelationer for RDCtyre mellem genomiske avlsværdier på nuværende data og nuværende model og på snell score data og snell score model 

Genetic trend for AI bulls for singlestep and twostep evaluation
Mean breeding values from singlestep evaluation and current twostep evaluation for AI bulls by birth year 

Genetic trends for singlestep evaluation and current evaluation
Plots of mean breeding values from singlestep evaluation and current evaluation 

Genotyped females getting a phenotype 
Comparison of singlestep breeding values for August22 and May22 evaluations for genotyped females, which have got phenotypic information since last evaluation  

IB3 test of snell score calving
Interbull valideringstest 3 for snell score model for alle tre racer 

Implementation of singlestep for breeding values for Dairy breeds
Final report about Singlestep Type traits 

Indavl i A-matrice og indavlsdepression in JER evaluering
Undersøgelse af effekt af at inddrage indavl i A-matrice samt indavlsdepression i snell score evaluaeringen for Jersey

Interbull test for singlestep type
Interbull test for singlestep for typeegenskaber 

Legarra Reverter regression 
Validation of singlestep evalaution with Legarra Reverter regression 

Legarra Reverter regression v2
Updated version. Validation of singlestep evalaution with Legarra Reverter regression 

Mean and STD for AI bulls and genotyped cows
Gennemsnit og spredning for typeegenskaber for genotypede køer og for AI tyre 

Monthly and weekly Singlestep for type traits
Dette er en test af resultaterne for månedlige og ugentlige singelstep GEBV for typeegenskaber

Monthly and weekly Singlestep for type traits v2
Dette er en opdateret test af resultaterne for månedlige og ugentlige singelstep GEBV for typeegenskaber

Ny viden fra Interbullmøde i Montréal, 30. maj til 3. juni 2022 
Opsummering af ny viden tilegnet Interbull-mødet i Montréal relateret til SingleStep (SS) evaluering i de forskellige lande

Plots of breeding values 
Breeding values of RDC bulls born 2010-2015 with many offspring 

Presentation 19 May type traits
Præsentation af eksempler på typeegenskaber i nuværende og singlestep evaluering

RDC bulls with few offspring, correlations to current evaluation
Korrelationer for RDCtyre med få afkom mellem genomiske avlsværdier på nuværende data og nuværende model og på snell score data og snell score model 

RDC cows, correlations to current evaluation
Korrelationer for RDCkøer mellem genomiske avlsværdier på nuværende data og nuværende model og på snell score data og snell score model 

RDC maternal parameters
Genetiske parametre for RDC for maternelle egenskaber

RDC maternal parameters v2
Opdaterede genetiske parametre for RDC for maternelle egenskaber

RDC sire trend og effekt af heterosis i modellen
Grafer over sire trend for RDC samt effekt af at inkludere heterosis i nuværende evaluering og i snell score evaluering 

RDC statistic with reduction of data by birth year
Undersøger hvilken effekt det har på statistiske parametre når kælvninger fra før 2000 ikke indgår 

Reliability type triat calculations
Comparison of reliability calculated based on the singlestep method and calculated based on the current twostep method

Report on analyses of RDC  
Undersøgelse af nuværende og snell score parametre for RDC modeller 

Report on analyses of RDC maternal single traits   
Undersøgelse af nuværende og snell score parametre for RDC for single traits modeller 

Report on analyses of RDC maternal single traits v2
Ny version af undersøgelse af nuværende og snell score parametre for RDC for single traits modeller 

Singlestep Claw traits for august 2022
Comparison of singlestep breeding values and breeding values from the current evaluation for seven claw traits for august 2022 

Singlestep Claw traits for august 2022 v2
Comparison of singlestep breeding values and breeding values from the current evaluation for seven claw traits for august 2022 

Singlestep partial QP transformation
Undersøgelse af effekt af singlestep med SNP solutions (partial QP transformation model), samt undersøgelse af at fjerne genotype på dyr født før 2005

Single Step test runs for yield for JER 7 March 2022
Undersøgelse af Singlestep Snp solution for Jersey 

Singlestep Type traits presentation 19 May - Trine Andersen
Præsentation af singlestep typeegenskaber, færdig version

Snell score calving evaluation for sire and parents
Undersøgelse af sammenhæng mellem tyres indeks og forældres indeks

Snell score calving evaluation for sire and parents v2
Undersøgelse af sammenhæng mellem tyres indeks og forældres indeks, opdateret version 

Snell score calving evaluation for sire and parents v3
Undersøgelse af sammenhæng mellem tyres indeks og forældres indeks

Snell score calving evaluation for sire and parents v4
Undersøgelse af sammenhæng mellem tyres indeks og forældres indeks samt sammenhæng mellem afkomsgruppegennemsnit for tyre og fædre 

Snell score calving evaluation for sire and parents v5
Undersøgelse af sammenhæng mellem tyres indeks og forældres indeks samt sammenhæng mellem to grupper af afkom indenfor tyre og mellem afkomsgruppegennemsnit for tyre og fædre 

Snell score calving evaluation for sire and parents v6
Undersøgelse af to grupper af afkom, hvis der inddrages BxD kalve

Statistics for traditional production model, full and reduced data
Undersøgelse af sammenhæng mellem tyres indeks og forældres indeks for den traditionelle test day model 

Summary of sire index differences
Beskrivende statistik over hvor meget afprøvede tyre ændrer index fra nuværende model til snell score model

Summary of sire index differences R2 above 0.40
Beskrivende statistik over hvor meget  tyre (sikkerhed over 0.40) ændrer index fra nuværende model til snell score model

Summary of sire index differences R2 above 0.85
Beskrivende statistik over hvor meget afprøvede tyre (sikkerhed over 0.85) ændrer index fra nuværende model til snell score model

The effect of mendelian sampling for JER protein 1st lactation
Undersøgelse af mendilain sampling for singlestep for Jersey

Three examples of RDC bulls with index for current and snell score evalautions
Sammenligne nuværende og snell score evaluering for tre konkrete RDC tyre 

Traditional production evaluation with simpler model
Undersøgelse af singlestep med en mere simpel model for produktionsegenskaberne for RDC 

Trends, correlations and variances for calving traits
Genetic trends for bulls, EBV correlations for bulls and genetic variances for the three breeds for calving traits 

 

AP 2

Input omkring ændrede forudsætninger i NTM
Diskuteret på nordisk møde for beslutningstagere

Input til beregning af økonomiske vægte 
Kort note og excelark omkring inputparametre

Opdatering af TMI-program så det inkluderer ungdyroverlevelse 
Kort note omkring opdatering af TMI-program

 

AP 3

Calving presentation 
Præsentation af nye ændringer i fødsels- og kælvningsevaluering 

En pct. af holsteinkøerne er rødbrogede
Artikel til Viking Avlsnyt eller VikingDanmarks hjemmeside

Flere pollede køer af alle racer
Artikel til Viking Avlsnyt eller VikingDanmarks hjemmeside

Forbedrede avlsværdital for eksteriøregenskaber
Artikel omkring ændringer af indekser for typeegenskaberne i forbindelse med single step 

Genomiske avlsværdital giver bedre avlsbeslutninger
Artikel, som dokumenterer, at genomiske avlsværdital mere præcist kan finde de avlsmæssigt bedste kvier end almindelige avlsværdier

Hvordan oversættes indekser for kødkvægstyre brugt på malkekøer?
Dokument der understøtter brugen af indekserne for kødkvæg brugt til malkekvæg gennem oversættelse til den registrerede skala

Improved indices for calving_ADF 
Artikel omkring ændringer af indekser for fødsel og kælvning

Improved indices for type_ADF 
Artikel omkring ændringer af indekser for typeegenskaberne i forbindelse med single step

Interbeef søgeside
Søgeside, der gør det nemt for brugerne at vælge de bedste avlsdyr på tværs af landegrænser

Jersey lægger mere vægt på klovsundhed i NTM
Artikel til NAV's hjemmeside, Viking Avlsnyt eller VikingDanmarks hjemmeside

Justering af avlsværdital for kælvning 
Artikel omkring ændringer af indekser for fødsel og kælvning 

Maintenance, efficiency and beef production
Survey of the factors that affect the economic values for saved feed and growth. The presentation was given at the NAV dairy webinar 19 January 2022.

Maintenance, efficiency and beef production, v2 - Line Hjortø
Survey of the factors that affect the economic values for saved feed and growth. The presentation was given at the NAV dairy meeting 19 may 2022 

Next generation of models for genetic evaluation_ADF
Artikel generelt omkring single step metoden

Nordic total merit index 
Use of sexed semen and beef semen in dairy herds, presentation for 19 May - Jørn Pedersen 

Ny metode til beregning af avlsværdital for malkeracerne
Artikel generelt omkring single step metoden 

Presentation, 19 May, type traits - UPDATED
Præsentation af udder som eksempel for en typeegenskab i nuværende og singlestep evaluering

Presentation, SS type traits 
Præsentation af nye singlestep avlsværdier for typeegenskaber - anvendt som præsentation hos bl.a. Viking Genetics

Ændringer for type og fødsel&kælvning i nov22_DNK
Kort beskrivelse af ændringerne for november 2022 evaluering